合成生物学 - 中国大学mooc
第一章 合成生物学概述
第一章 单元测验
1、合成生物学的研究内容包括:
A、生物大分子的合成与模块化
B、生物基因组的合成、简化与重构
C、合成代谢网络
D、基因线路的设计与构建
E、细胞群体系统及多细胞体系统研究
2、合成生物学的主要特点是:
A、工程化的特点
B、广泛使用数学模拟工具
C、标准化零件的特点
D、贡献共享的特点
E、网络分析是其核心内容之一
3、与基因工程相比较,合成生物学的特点包括:
A、工程化的特点
B、广泛使用数学模拟工具
C、标准化零件的特点
D、学科交叉的特点
E、网络分析是其核心内容之一
4、合成生物学在生物医药领域里的应用体现在哪些方面:
A、开发天然药物
B、免疫细胞设计
C、研制诊断试剂盒
D、开发生产疫苗
E、个体化医疗
5、生物安全包括哪些方面?
A、合成生物的泄露对研究人员造成的伤害
B、合成生物的泄露对公共环境造成的伤害
C、运用合成生物技术合成致命性的病原体,并用于恐怖袭击
D、用合成生物技术发动生化战争
E、用合成生物技术合成新的或已经灭绝的物种以增加生物多样性
6、美国总统生命伦理委员会对发展合成生物学提出的原则包括:
A、公共受益原则
B、责任管理原则
C、学术自由和责任原则
D、民主评议原则
E、公平公正原则
7、现代生命科学的发展历史上,所经历的3次革命是:
A、分子生物学革命
B、遗传工程革命
C、基因组学革命
D、蛋白质组学革命
E、合成生物学革命
8、2000年,合成生物学作为一项新的研究领域正式诞生的标志是:
A、人工合成脊髓灰质炎病毒
B、构建双稳态基因调控开关
C、在大肠杆菌中成功建立合成青蒿素的网络
D、构建生物振荡器
E、人工合成了噬菌体φX174的基因组
9、合成生物学在哪些领域具有较大的应用前景?
A、生物医药领域
B、新能源生产领域
C、新材料领域
D、环境领域
E、农业生产领域
10、按照功能,遗传线路可以分为逻辑遗传线路和功能遗传线路。
11、合成生物学就是从头设计和构建自然界中不存在的生物系统,也包括改造现有的生物系统。
12、合成生物学是汇聚研究范式的典型。
13、汇聚技术是生物医学领域的新手段。
14、合成生物学存在巨大潜在危险,如制造病毒等生化武器,因此人类不应该去发展合成生物学。
15、一旦合成生物学知识被别有用心的人滥用,如果这不是科学家的意愿,科学家就可以不负任何责任。
16、从核心技术角度出发,可以认为,合成生物学是按照一定的规律和已有的知识,设计和建造新的生物部件、装置和系统;或者重新设计已有的天然生物系统,从而为人类的特殊目的服务。
17、合成生物学打破了“生命”与“非生命”的界限,可以从头合成人工的生命。
第一章 单元作业
1、请以3个问题为线索,写一篇不少于500字的短文来回答这3个问题。本次作业成绩,占最后总成绩的20%。 Q1:如果真的有恐怖分子用生物武器进行袭击,你认为可能的袭击方式有哪些?每种袭击方式该如何应对? Q2:通常哪些场所是恐怖分子袭击的主要目标?针对这些目标,我们应该如何加强防御? Q3:打击/约束可能的生物恐怖袭击者的法宝是什么?我们将如何遏制和粉碎生物恐怖活动的威胁?
第二章 标准化的生物合成系统
第二章 单元测验
1、组成性启动子,通常启动哪些基因的表达?
A、报告基因
B、奢侈基因
C、管家基因
D、抗性基因
E、应激蛋白基因
2、能与阻遏蛋白相结合的调控序列,叫做
A、RBS
B、operon
C、promoter
D、operator
E、SD序列
3、关于核糖体结合位点的叙述,错误的是:
A、核糖体结合位点缩写为RBS,是能与核糖体结合的RNA序列。
B、原核生物的核糖体结合位点又称为SD序列。
C、原核生物核糖体结合位点富含嘌呤结构,能与富含嘧啶的16SrRNA3‘端结合。
D、RBS与核糖体结合的强度,取决于其自身的结构及其与AUG之间的距离。
E、核糖体结合位点可以启动基因的转录。
4、关于“系统”的描述,错误的是:
A、是多个装置组成的更加复杂的级联线路,或者调控网络。
B、不同装置之间可通过串联、并联、前馈、反馈等连接,形成系统。
C、转录水平的调控网络,是常见的系统。
D、基因振荡器、脉冲发生器、反馈环路都属于系统。
E、若干个生物模块,可以组成系统。
5、关于生物模块(biological module)叙述错误的是:
A、是一组细胞内区域化的生物装置。
B、生物模块会执行特定的复杂功能。
C、生物模块在细胞内,是与Part、Device和System并列的一个层次结构。
D、是为了降低合成生物系统的复杂程度而提出来的概念,强调“功能独立”。
E、细胞内的生物模块,往往是具有特定功能的途径,如代谢途径、信号转导途径等。
6、RIPS是用于衡量哪一个水平的标准化量值?
A、转录水平
B、翻译水平
C、复制水平
D、代谢水平
E、信号传递水平
7、生物系统的标准化包括:
A、装配零部件的物理标准化
B、生物功能的定量分析标准化
C、标准零部件的注册登记
D、解耦方法的标准化
E、系统操作标准化
8、合成生物学工程化的研究策略中涉及的概念有:
A、标准化
B、层次化
C、解耦
D、连接
E、抽提
9、相比于基因工程,合成生物学又拓展出的一些工具包括:
A、同尾酶
B、PCR
C、DNA的从头合成
D、标准化
E、抽提
10、合成生物系统的层次包括:
A、模块
B、基因部件
C、系统
D、生物砖
E、装置
11、下列哪些可以成为生物砖?
A、报告基因
B、复制子
C、酶切位点
D、选择标记
E、引物序列
12、常见的装置的种类有:
A、蛋白质生成装置
B、转换器
C、基因开关
D、接收器
E、逻辑门
13、关于生物积块(Biobuilder)的描述,正确的是:
A、也叫生物砖,是标准化的生物元件。
B、生物积块有大有小,Part、Device和System都可能成为生物积块。
C、生物积块都具有标准的酶切位点。
D、是合成生物系统的基本单元,彼此之间可以互相连接。
E、生物模块也可以成为生物积块。
14、下列哪些是组合型Part (composite part) ?
A、蛋白质生成装置
B、转换器
C、RBS
D、启动子
E、增强子
15、一个标准的生物砖BioBrick,它的前缀和后缀中含有哪些限制性内切酶的酶切位点?
A、PstI
B、XhoI
C、EcoRI
D、XbaI
E、SpeI
16、常见的报告基因包括:
A、GFP
B、LacZ
C、LacY
D、LacA
E、荧光素酶
17、标准量化系统包括哪些要素?
A、标准的前后缀
B、技术进步
C、报告基因
D、PoPS
E、RIPS
18、17. β-半乳糖苷酶是最常用、最成熟的一种报告基因。其主要用途包括:
A、用于研究启动子的效率和启动子不同位点突变对表达效率的影响。
B、用于研究表达系统中RBS、增强序列等调控序列的功能。
C、用来衡量载体的表达特性和外源物质对表达调控的影响。
D、以融合基因的形式用于研究外源基因的表达及其规律。
E、用于研究蛋白质在细胞内的表达位置。
19、对于一个底盘生物体来讲,其固有“噪声”包括:
A、细胞周期不同
B、细胞大小不同
C、细胞的营养状况不同
D、细胞遗传背景的不同
E、转录或翻译的随机性
20、关于PoPS,叙述正确的是:
A、是衡量基因转录水平的一个量值,是转录水平的通用信号载体。
B、在基因线路中,PoPS相当于电路中的电流。
C、指RNA聚合酶每秒钟通过DNA分子上某一点的数量。
D、也称为PAR,指每秒钟到达某一特定DNA位点的RNA聚合酶的数量。
E、PoPS的概念可以规范人们对基因线路进行表征。
21、自下而上的研究策略主要用于分析阶段。
22、解耦和抽提是分析阶段的研究方法。
23、标准化贯穿合成生物学研究的始终。
24、解耦是把复杂问题简单化的过程,即把复杂问题分解成简单问题,把复杂系统分解成简单要素的过程。
25、抽提包括建立装置和模块的层次,允许不同层次间的分离和有限的信息交换、开发重设计的和简化的装置/模块、构建具有统一接口的部件库等等。
26、合成生物系统的标准化,包括对生物功能进行定义及特征描述,建立识别生物部件的方法,生物部件的测量,以及标准生物部件的注册登记等等。
27、标准化是所有工程学科的关键部分。
28、与启动基因表达有关的DNA序列,叫做启动子。
29、启动子可以分为组成性启动子和可调控的启动子。
30、Operator就是指原核生物基因表达调控的操纵子。
31、终止子能完全终止转录,RNA聚合酶到这里都会从DNA上脱落下来。
32、转录终止子包括UAA、UAG、UGA。
33、Part是指具有一定功能的DNA序列,是最基本的生物积块。
34、生物装置Device,也可以认为是组合型part。
35、生物砖(BioBrick)就是标准的生物零件,像其他行业的标准零件一样,生物砖彼此之间可以相互组合连接,也可以拆卸后再同其他零件重新组合。
36、一个标准的生物砖(BioBrick),其前后缀之间不能含有EcoRI酶切位点。
37、GFP是一种常见指示蛋白,可以在蓝光的激发下,呈现出绿色荧光。通过不同位点的氨基酸突变,可以使其呈现蓝、黄、红等不同的颜色。
38、在一个基因线路中,启动子相当于电池,可以产生RIPS流。
39、发展标准化测量系统,有助于对生物积块进行规范化表征。
40、报告基因不仅可以用来指示基因表达的数量,还可指示表达蛋白的位置。
第一章 单元测验
1、合成生物学的研究内容包括:
A、生物大分子的合成与模块化
B、生物基因组的合成、简化与重构
C、合成代谢网络
D、基因线路的设计与构建
E、细胞群体系统及多细胞体系统研究
2、合成生物学的主要特点是:
A、工程化的特点
B、广泛使用数学模拟工具
C、标准化零件的特点
D、贡献共享的特点
E、网络分析是其核心内容之一
3、与基因工程相比较,合成生物学的特点包括:
A、工程化的特点
B、广泛使用数学模拟工具
C、标准化零件的特点
D、学科交叉的特点
E、网络分析是其核心内容之一
4、合成生物学在生物医药领域里的应用体现在哪些方面:
A、开发天然药物
B、免疫细胞设计
C、研制诊断试剂盒
D、开发生产疫苗
E、个体化医疗
5、生物安全包括哪些方面?
A、合成生物的泄露对研究人员造成的伤害
B、合成生物的泄露对公共环境造成的伤害
C、运用合成生物技术合成致命性的病原体,并用于恐怖袭击
D、用合成生物技术发动生化战争
E、用合成生物技术合成新的或已经灭绝的物种以增加生物多样性
6、美国总统生命伦理委员会对发展合成生物学提出的原则包括:
A、公共受益原则
B、责任管理原则
C、学术自由和责任原则
D、民主评议原则
E、公平公正原则
7、现代生命科学的发展历史上,所经历的3次革命是:
A、分子生物学革命
B、遗传工程革命
C、基因组学革命
D、蛋白质组学革命
E、合成生物学革命
8、2000年,合成生物学作为一项新的研究领域正式诞生的标志是:
A、人工合成脊髓灰质炎病毒
B、构建双稳态基因调控开关
C、在大肠杆菌中成功建立合成青蒿素的网络
D、构建生物振荡器
E、人工合成了噬菌体φX174的基因组
9、合成生物学在哪些领域具有较大的应用前景?
A、生物医药领域
B、新能源生产领域
C、新材料领域
D、环境领域
E、农业生产领域
10、按照功能,遗传线路可以分为逻辑遗传线路和功能遗传线路。
11、合成生物学就是从头设计和构建自然界中不存在的生物系统,也包括改造现有的生物系统。
12、合成生物学是汇聚研究范式的典型。
13、汇聚技术是生物医学领域的新手段。
14、合成生物学存在巨大潜在危险,如制造病毒等生化武器,因此人类不应该去发展合成生物学。
15、一旦合成生物学知识被别有用心的人滥用,如果这不是科学家的意愿,科学家就可以不负任何责任。
16、从核心技术角度出发,可以认为,合成生物学是按照一定的规律和已有的知识,设计和建造新的生物部件、装置和系统;或者重新设计已有的天然生物系统,从而为人类的特殊目的服务。
17、合成生物学打破了“生命”与“非生命”的界限,可以从头合成人工的生命。
第一章 单元作业
1、请以3个问题为线索,写一篇不少于500字的短文来回答这3个问题。本次作业成绩,占最后总成绩的20%。 Q1:如果真的有恐怖分子用生物武器进行袭击,你认为可能的袭击方式有哪些?每种袭击方式该如何应对? Q2:通常哪些场所是恐怖分子袭击的主要目标?针对这些目标,我们应该如何加强防御? Q3:打击/约束可能的生物恐怖袭击者的法宝是什么?我们将如何遏制和粉碎生物恐怖活动的威胁?
第二章 标准化的生物合成系统
第二章 单元测验
1、组成性启动子,通常启动哪些基因的表达?
A、报告基因
B、奢侈基因
C、管家基因
D、抗性基因
E、应激蛋白基因
2、能与阻遏蛋白相结合的调控序列,叫做
A、RBS
B、operon
C、promoter
D、operator
E、SD序列
3、关于核糖体结合位点的叙述,错误的是:
A、核糖体结合位点缩写为RBS,是能与核糖体结合的RNA序列。
B、原核生物的核糖体结合位点又称为SD序列。
C、原核生物核糖体结合位点富含嘌呤结构,能与富含嘧啶的16SrRNA3‘端结合。
D、RBS与核糖体结合的强度,取决于其自身的结构及其与AUG之间的距离。
E、核糖体结合位点可以启动基因的转录。
4、关于“系统”的描述,错误的是:
A、是多个装置组成的更加复杂的级联线路,或者调控网络。
B、不同装置之间可通过串联、并联、前馈、反馈等连接,形成系统。
C、转录水平的调控网络,是常见的系统。
D、基因振荡器、脉冲发生器、反馈环路都属于系统。
E、若干个生物模块,可以组成系统。
5、关于生物模块(biological module)叙述错误的是:
A、是一组细胞内区域化的生物装置。
B、生物模块会执行特定的复杂功能。
C、生物模块在细胞内,是与Part、Device和System并列的一个层次结构。
D、是为了降低合成生物系统的复杂程度而提出来的概念,强调“功能独立”。
E、细胞内的生物模块,往往是具有特定功能的途径,如代谢途径、信号转导途径等。
6、RIPS是用于衡量哪一个水平的标准化量值?
A、转录水平
B、翻译水平
C、复制水平
D、代谢水平
E、信号传递水平
7、生物系统的标准化包括:
A、装配零部件的物理标准化
B、生物功能的定量分析标准化
C、标准零部件的注册登记
D、解耦方法的标准化
E、系统操作标准化
8、合成生物学工程化的研究策略中涉及的概念有:
A、标准化
B、层次化
C、解耦
D、连接
E、抽提
9、相比于基因工程,合成生物学又拓展出的一些工具包括:
A、同尾酶
B、PCR
C、DNA的从头合成
D、标准化
E、抽提
10、合成生物系统的层次包括:
A、模块
B、基因部件
C、系统
D、生物砖
E、装置
11、下列哪些可以成为生物砖?
A、报告基因
B、复制子
C、酶切位点
D、选择标记
E、引物序列
12、常见的装置的种类有:
A、蛋白质生成装置
B、转换器
C、基因开关
D、接收器
E、逻辑门
13、关于生物积块(Biobuilder)的描述,正确的是:
A、也叫生物砖,是标准化的生物元件。
B、生物积块有大有小,Part、Device和System都可能成为生物积块。
C、生物积块都具有标准的酶切位点。
D、是合成生物系统的基本单元,彼此之间可以互相连接。
E、生物模块也可以成为生物积块。
14、下列哪些是组合型Part (composite part) ?
A、蛋白质生成装置
B、转换器
C、RBS
D、启动子
E、增强子
15、一个标准的生物砖BioBrick,它的前缀和后缀中含有哪些限制性内切酶的酶切位点?
A、PstI
B、XhoI
C、EcoRI
D、XbaI
E、SpeI
16、常见的报告基因包括:
A、GFP
B、LacZ
C、LacY
D、LacA
E、荧光素酶
17、标准量化系统包括哪些要素?
A、标准的前后缀
B、技术进步
C、报告基因
D、PoPS
E、RIPS
18、17. β-半乳糖苷酶是最常用、最成熟的一种报告基因。其主要用途包括:
A、用于研究启动子的效率和启动子不同位点突变对表达效率的影响。
B、用于研究表达系统中RBS、增强序列等调控序列的功能。
C、用来衡量载体的表达特性和外源物质对表达调控的影响。
D、以融合基因的形式用于研究外源基因的表达及其规律。
E、用于研究蛋白质在细胞内的表达位置。
19、对于一个底盘生物体来讲,其固有“噪声”包括:
A、细胞周期不同
B、细胞大小不同
C、细胞的营养状况不同
D、细胞遗传背景的不同
E、转录或翻译的随机性
20、关于PoPS,叙述正确的是:
A、是衡量基因转录水平的一个量值,是转录水平的通用信号载体。
B、在基因线路中,PoPS相当于电路中的电流。
C、指RNA聚合酶每秒钟通过DNA分子上某一点的数量。
D、也称为PAR,指每秒钟到达某一特定DNA位点的RNA聚合酶的数量。
E、PoPS的概念可以规范人们对基因线路进行表征。
21、自下而上的研究策略主要用于分析阶段。
22、解耦和抽提是分析阶段的研究方法。
23、标准化贯穿合成生物学研究的始终。
24、解耦是把复杂问题简单化的过程,即把复杂问题分解成简单问题,把复杂系统分解成简单要素的过程。
25、抽提包括建立装置和模块的层次,允许不同层次间的分离和有限的信息交换、开发重设计的和简化的装置/模块、构建具有统一接口的部件库等等。
26、合成生物系统的标准化,包括对生物功能进行定义及特征描述,建立识别生物部件的方法,生物部件的测量,以及标准生物部件的注册登记等等。
27、标准化是所有工程学科的关键部分。
28、与启动基因表达有关的DNA序列,叫做启动子。
29、启动子可以分为组成性启动子和可调控的启动子。
30、Operator就是指原核生物基因表达调控的操纵子。
31、终止子能完全终止转录,RNA聚合酶到这里都会从DNA上脱落下来。
32、转录终止子包括UAA、UAG、UGA。
33、Part是指具有一定功能的DNA序列,是最基本的生物积块。
34、生物装置Device,也可以认为是组合型part。
35、生物砖(BioBrick)就是标准的生物零件,像其他行业的标准零件一样,生物砖彼此之间可以相互组合连接,也可以拆卸后再同其他零件重新组合。
36、一个标准的生物砖(BioBrick),其前后缀之间不能含有EcoRI酶切位点。
37、GFP是一种常见指示蛋白,可以在蓝光的激发下,呈现出绿色荧光。通过不同位点的氨基酸突变,可以使其呈现蓝、黄、红等不同的颜色。
38、在一个基因线路中,启动子相当于电池,可以产生RIPS流。
39、发展标准化测量系统,有助于对生物积块进行规范化表征。
40、报告基因不仅可以用来指示基因表达的数量,还可指示表达蛋白的位置。